本实用新型公开了一种水运工程沉降缝结构，包括第一挡墙和第二挡墙，所述第一挡墙和第二挡墙设置有加固机构；所述加固机构包括第一钢板、第二钢板、泡沫铝板和珍珠棉；所述第一挡墙右侧和第二挡墙左侧均固定连接有第一钢板的一端，所述第一钢板的另一端倾斜焊接有多个泡沫铝板，且多个泡沫铝板之间相互焊接，所述泡沫铝板的另一端焊接有第二钢板，且多个泡沫铝板之间填充有珍珠棉。本实用新型通过挡墙上的钢板和钢板内的泡沫铝板以及泡沫铝板内的珍珠棉，不仅可以利用双钢板和倾斜的泡沫铝板，增加加固结构的强度，提升了沉降缝的抗压抗冲击能力，而且在多个泡沫铝板之间填充珍珠棉，能够提升减震的性能。