本实用新型提供一种分拣机构及其自动化分拣系统，包括辊式输送机、直线输送机构、双轴液压缸、底板、转动板、顶板、连接臂和电机，直线输送机构设置在辊式输送机的底部，而直线输送机构固定安装有双轴液压缸，底板固定安装在双轴液压缸的动力输出端，转动板通过转轴转动安装在底板上，顶板上设有叉板，而顶板上的叉板位于辊式输送机内输送辊之间的间隙中，其中顶板的两侧分别通过连接臂与转动板的两侧连接，而连接臂与顶板以及转动板之间为转动连接。通过电机带动转动板转动进而连接臂驱动顶板实现摆动，进而顶板将辊式输送机上的物料顶起并向实现倾斜，进而达到分拣的效果，由于电机的转动能够带动顶板摆动，进而实现双向分拣。