本实用新型内容公开了一种带有气体过滤器的厌氧工作站，涉及厌氧工作站领域，现有厌氧工作站无层流内循环过滤器，具有较高的生物样本交叉污染和有害微生物泄漏的风险，为降低风险，本发明提出一种带有气体过滤器的厌氧工作站，可通过设置的气体过滤器机构，使厌氧工作站中的气体经过气体过滤器机构后在工作舱内形成无菌层流气体，经过导流孔进入回流通道被风机再次吸入气体过滤器，形成气流内循环，由传感器检测，经控制器机构判断是否含有氧气，如果有氧气，输入氢气与氮气的混合气，经过钯催化剂的催化反应去除氧气，形成无氧无菌的层流气体环境，降低了样品间的交叉污染和有害微生物泄漏的风险，主要用于厌氧微生物的培养与操作。