本实用新型涉及一种模块化医用隔离仓以及医疗机构，模块化医用隔离仓包括主箱仓、以及进风单元和排风单元，所述主箱仓内部具有负压隔离病房区室和缓冲区室，所述负压隔离病房区室与缓冲区室相互隔离、且在两者之间设有用于进出的气密门，所述主箱仓上设有连通负压隔离病房区室的第一进风口和第一排风口、以及连通缓冲区室的第二进风口和第二排风口，所述进风单元包括进风处理装置，所述进风处理装置通过进风管与第一进风口和第二进风口都相连，所述排风单元包括排风处理装置，所述排风处理装置通过排风管与第一排风口和第二排风口都相连，所述进风处理装置和排风处理装置可对空气进行无害化处理；所述负压隔离病房区室内设有医疗器械和生活设施。