本实用新型公开了一种地源热泵系统的地埋管底穿管结构，包括地源供水管和地源回水管，所述地源供水管和地源回水管水平铺设在回填沙层中，且所述地源供水管和地源回水管从底部穿过地库底板；所述地库底板上设有预埋套管，所述预埋套管内设置止水环，所述地源供水管和地源回水管分别从预埋套管内穿过；所述地库底板为混凝土底板。本实用新型的地源热泵系统的地埋管底穿管结构采用底穿管结构，不仅结构简单、有效防水止水，而且不影响施工周期、降低成本、减少因沉降导致地源管折扁、拉损、渗漏风险。