本实用新型公开了一种胶原蛋白肽生产系统，包括脱糖罐、粉碎机、酶液存储罐、反应釜、过滤机、蒸发器、高压泵、干燥塔，所述胶原蛋白肽的原材料通过脱糖罐进料口进行填充，所述脱糖罐的出料口与粉碎机的进料口相连，所述粉碎机的出料口通过连接管道与酶液存储罐相通并且在其中在线酶解，经过酶解的原料通过所述酶液存储罐的出料口进入反应釜进料口，所述反应釜的出料口与过滤机相连接，所述过滤机的出料口运出的经过过滤的原料进入蒸发器进料口，所述蒸发器的出料口与高压泵相通，并通过高压泵泵送至干燥塔。本实用新型结构简单，设计合理，提高了胶原蛋白肽制作的效率，并且通过过滤机完成多级过滤，提高胶原蛋白肽制作的品质。