本实用新型涉及一种胶囊药粉自动填充机，其包括自动填充机壳体、出囊槽以及收集筒，收集筒下方设置有底座，底座上与其长边平行开设有滑槽，滑槽上滑动连接有振动座，底座一端与滑槽平行设置有气缸，气缸的活塞端与振动座侧壁连接，收集筒为可拆卸固定在振动座顶部的两个，两收集筒中心的连线与滑槽平行，每一收集筒上均设有过滤筛，过滤筛通过顶部侧壁凸出设有的挡板放置在收集筒上，收集筒侧壁顶部设有固定过滤筛的固定装置，振动座上方设置有敲击组件。本实用新型的胶囊药粉自动填充机结构简单、使用方便，在对胶囊进行收集的同时可将填充好的胶囊与多余的药粉分离，节省用户后续分离的时间，减小用户的工作量。