本实用新型属于人工智能及设备管理技术领域，特别涉及一种笼盒智能垫料分装系统。包括笼具整理模块、分布式供料机、周转运输车、运输车定位模块及工业机器人，笼具整理模块用于将笼盒整理到设定的位置；分布式供料机用于向笼盒内注入垫料；周转运输车用于笼盒的承载和输送；运输车定位模块用于定位周转运输车；工业机器人用于将笼盒在各工位之间进行传输；工业机器人的执行端设置端拾器模块，端拾器模块用于夹持笼盒。本实用新型可以代替人工进入实验动物房，对笼架上的笼盒进行取放操作，对笼具进行清洗的垫料倾倒、清洗上料、分装新垫料，具有小型化和提高经济性。