本实用新型公开了一种生物反应器的取样装置，包括安装杆，所述安装杆上等间距固定安装有多个安装块，所述安装块远离安装杆的一侧设有吸料块，用于取样时对物料进行抽吸取样，所述安装块上安装有调节机构，用于调节吸料块的位置，所述调节机构包括滑块、转动杆、调节轮，所述安装块靠近吸料块的一侧沿安装杆轴向开设有滑槽，所述滑块滑动安装在滑槽内，且内部开设有螺纹孔，所述转动杆螺纹转动安装在螺纹孔内，所述滑槽两侧壁上开设有转动槽。使用时，将安装杆插入生物反应器中，安装杆上的多个吸料块处于生物反应器的不同高度，通过抽气装置的作用可将不同深度的反应物料吸入相应的储料室内，便于使用者获得不同深度的反应物料样本。