本实用新型公开了一种海底废水泵房结构，旨在解决技术问题。其包括衬砌和泵房，所述衬砌由初期支护和二次衬砌组成，所述初期支护包括锚杆、钢筋网、钢架及喷射混凝土，所述二次衬砌为钢筋混凝土，所述泵房结构分为上下两层，所述泵房位于所述衬砌下方，其上方设有连接通道；所述泵房通过设置隔墙分开，设有两个集水池。本实用新型的废水泵房衬砌为永久性承载结构，结构更牢固，泵房结构分为上下两层，能实现各区疏干检修，实现结构渗水与营运清洗污水、消防污水分离排放，有效利用了隧道的内部空间，有效提高排水效率。