本实用新型涉及有机分析仪器技术领域，特别是涉及一种生物毒素检测装置，包括：进样机构，所述进样机构包括样品管和试剂管，所述样品管的上方安装有进样针，所述进样针安装在驱动臂上，所述驱动臂与第一伸缩气缸的伸缩杆连接；反应机构，所述反应机构包括反应盘，所述反应盘均与所述进样针和试剂管通过管道连接；检测机构；清洗机构，所述清洗机构包括洗涤头，所述洗涤头安装在所述反应盘的上方。本实用新型解决现有技术中生物毒素检测结果不准确的问题，其中进样机构将样品管和试剂管分离，再通过反应机构将样品和试剂混合均匀，避免出现试剂中可特异识别生物毒素的氨基酸与生物毒素结合不完全的现象，最终的检测结果更为准确。