本实用新型公开了带有自动切换功能的医用分子筛制氧系统，涉及分子筛制氧技术领域，为解决现有技术中的分子筛制氧机内部的两组分子筛管在使用的过程中只能实现相互的循环切换，无法针对分子筛内部的沸石进行冲洗再生的问题。所述分子筛制氧机的顶部设置有触摸控制屏，所述分子筛制氧机的一端设置有换气风窗，所述换气风窗的下方设置有纯氧出口，所述分子筛制氧机的另一端设置有进气格栅，所述分子筛制氧机的内部设置有空气吸泵，且空气吸泵与进气格栅组合连接，所述空气吸泵的一侧设置有第一分子筛管，且第一分子筛管的另一侧设置有第二分子筛管，所述第二分子筛管的下方设置有空气压缩机，所述空气压缩机的一侧设置有雾化组件。