本实用新型公开了一种用于临床的药物混合搅拌装置，包括箱体和混合器皿，所述箱体的内部设置有电机，所述电机的输出轴上连接有第一转杆，所述第一转杆的两端顶部均设置有第一永磁体，所述箱体的顶部设有盖板，所述混合器皿活动连接于盖板的顶部，所述混合器皿的内部设有隔板，所述隔板的中心处嵌装有密封轴承，所述密封轴承的内环中过盈连接有搅拌杆。由电机带动第一转杆上的第一永磁体转动，从而带动第二永磁体和搅拌杆转动，对药物进行混合，将搅拌杆通过密封轴承和隔板固定在混合器皿中，搅拌完成之后不用将搅拌杆取出，避免药物滴落，同时便于搅拌杆、混合器皿的清理。