本实用新型公开了一种防疫诊室结构，包括墙体、地板和天花板，诊室内沿诊室的宽度方向设有诊断用桌子；沿诊室的长度方向，桌子的一侧为医生侧且其另一侧为患者侧，桌子的患者侧及其长度方向的两端分别设有落地的挡板，桌子宽度方向的中部向上连接有透明隔板，桌面上方的透明隔板上设有用于传递物品的窗口；透明隔板与天花板之间具有间隔；桌子两侧的诊室内分别设有椅子，诊室内于医生侧设有送风管，送风管伸出墙体并连接有新鲜风源，诊室内的送风管上设有送风口；诊室内于患者侧的顶部设有安装在天花板的回风口。由于医生侧的气压始终大于患者侧，因而避免了细菌或病毒由患者侧传入医生侧，对医生起到有效地保护。