本实用新型公开了一种生物反应器灌流培养装置，包括生物反应器，以及连通于生物反应器上的循环管路；循环管路包括延伸进生物反应器的反应内腔中的吸液管路和回液管路，在吸液管路上设置有蠕动泵，吸液管路的出液端通过出液三通阀分别连通有第一、第二中空纤维柱，第一、第二中空纤维柱的出液端分别与设置在回液管路进液端的回液三通阀相连通；第一中空纤维柱与出液、回液三通阀之间的连接管路，以及第二中空纤维柱与出液、回液三通阀之间的连接管路均为热塑管。本实用新型优点在于结构简单，操作简便，能够有效解决灌流培养时的细胞碎片堵塞现象，确保灌流培养能够持续进行，避免培养失败。