本实用新型公开了一种汽车天窗防水结构，包括：汽车顶棚框架、前玻璃面板、前玻璃安装结构、后玻璃安装结构、后玻璃面板和钣金底板，汽车顶棚框架用于安装汽车的天窗，钣金底板设于汽车顶棚框架的下端，后玻璃面板在驱动装置的驱动下可水平打开形成汽车的天窗；其中，钣金底板包括依次连接第一延伸段、托盘结构和第二延伸段，第一延伸段设于前玻璃面板的下方，托盘结构设于前玻璃安装结构和后玻璃安装结构的下方，第二延伸段设于后玻璃面板的下方，托板结构的中间位置具有下凹的槽形。通过对本实用新型的应用，更好地保护了汽车天窗的内部结构，避免了积水浸泡导致密封条失效，大大降低了积水浸泡带来的风险，进一步延长了汽车天窗的使用寿命。