本实用新型公开了一种医用负压吸引系统的消毒灭菌装置，包括灭菌箱，所述灭菌箱的内腔中心处固定设有高温灭菌架，所述高温灭菌架的内侧固定设有电热管，所述灭菌箱的内腔两侧均固定设有活性炭过滤盒，所述活性炭过滤盒的外侧固定设有紫外灯。本实用新型通过紫外灯接入电源产生紫外光对废气做杀菌处理，活性炭过滤盒对废气做除臭过滤处理，电热管发出200摄氏度的高温进行高温灭菌处理，消毒灭菌后的废气由排气管进入废气管中，最后由废气管排入大气，该消毒灭菌装置采用高温灭活的技术原理以实现处理来自于医院真空吸引系统排出的高度污染的废气，将其中可能夹带的细菌、微生物、病毒等灭活后洁净排放，实用性好。