本实用新型公开了一种具有分类消毒功能的医疗器械消毒设备，包括底座，所述底座顶部的中心处固定连接有消毒箱，所述消毒箱内腔两侧的中心处均固定连接有固定板，所述固定板顶部的四周均开设有通槽，所述固定板底部的中心处固定连接有固定箱，且固定箱内腔顶部的中心处栓接有低速电机，所述低速电机的输出轴贯穿固定板并固定连接有放置框。本实用新型通过高温喷雾机构、消毒喷淋机构和紫外线消毒灯的配合，便于使用者使用不同的消毒方式对不同的医疗器械进行消毒，也可对医疗器械进行不同消毒方式结合使用，加强了对医疗器械进行消毒的杀菌效果，便于使用者对医疗器械进行集中消毒，同时也节约了医院采购不同消毒设备的成本。