本实用新型公开了基于荧光光纤的温度控制器，包括控制箱、控制面板、支撑座、保护机构和底座，所述控制箱内部的中心位置处设有中央处理器，且中央处理器的内壁与控制箱固定连接，并且中央处理器远离控制箱一侧的外壁上设有调节仪，所述调节仪的一端与控制箱内壁固定连接，且一侧的控制箱内部固定有通讯端口，且通讯端口一侧的控制箱内部设有光纤连接器，并且光纤连接器的一端延伸至控制箱的内部，所述光纤连接器一侧的控制箱内部固定有底座，且底座上方的控制箱内部固定有两组支撑座。本实用新型不仅实现了温度控制器对荧光光纤探头的保护，避免了外部拉动荧光光纤时造成荧光光纤转接口的脱落损坏，而且提高了荧光光纤温度控制器的使用寿命。