一种基于微纳米气泡技术的鱼菜共生系统，该系统包括养殖池、竖流分离器、物理过滤池、基质栽培槽、生物滤池、微纳米气泡快速发生装置以及尾水处理池。养殖池的上排污水和底排污水经竖流分离器分离后的清水，经过物理过滤池、基质栽培槽、生物滤池、微纳米气泡快速发生装置后流回养殖池循环利用；养殖池的底排污水、经竖流分离器分离后的污水以及物理过滤池的排污水进入尾水处理池进行处理。本实用新型的有益效果是：微纳米气泡可迅速增氧，满足整个系统鱼类、蔬菜、微生物的生长代谢需求；微纳米气泡吸附颗粒物便于澄清水体；基质栽培槽和生物滤池的双重微生物处理，水质处理效果好，可实现高密度养殖；系统污水零排放，绿色节能；鱼菜双丰收。