本实用新型属于气体水合物技术应用领域，具体涉及到一种二氧化碳水合物微肥制备装置。包括反应器单元、供气管路、供液管路和压缩单元，供气管路、供液管路分别与反应器单元的内腔体连通，压缩单元位于反应器单元的下方，且压缩单元与反应器单元的底部连通。其二氧化碳水合物微肥的合成原料简单，合成流程短且不涉及化学反应，安全性好，可持续进行且生产效率较好，合成的二氧化碳水合物微肥含二氧化碳饱和度高，单位体积储气量高，自保护效应好，便于储存和运输；二氧化碳水合物微肥微量元素的组分可调节，微肥分解后的产物为二氧化碳、水以及微量元素，无污染，无残渣，施用后不会改变土壤的性质，可同时提供植物生长所需的水、二氧化碳与微量元素。