本实用新型实施例公开了一种堆叠式智能文件柜和智能文件存储系统，其中的堆叠式智能文件柜，包括：至少一个文件存储单元箱和一个电控箱；文件存储单元箱与电控箱为堆叠设置；电控箱包括：控制装置；柜体包括文件存储区和设备安装区，文件存储区位于设备安装区和柜门之间；控制装置与自动盘库装置电连接；自动盘库装置安装在设备安装区内，用于根据控制装置发送的第一控制命令读取放置在文件存储区中的物品上的RFID标签，并将读取的物品信息发送给控制装置。本实用新型的堆叠式智能文件柜和智能文件存储系统，具有智能控制、高可靠性、高保密性、易操作、易扩展等特点，可以对物品进行智能化存储管理，提升了操作准确性，节省了操作的时间。