本实用新型公开了一种具有杀菌功能的智能马桶结构，在陶瓷本体的中前部设有便池，在靠近后部设有安装槽，在安装槽的侧壁靠近上端设有通往便池的刷圈喷射口，其特征在于：安装槽内安装有底板，所述的底板上表面设有控制单元和液泵，下表面设有药箱和控制阀；所述的控制阀包括位于自来水进水口、陶瓷底部喷射口和陶瓷内壁刷圈进水口；所述的陶瓷内壁刷圈进水口同刷圈喷射口连接；药箱内的出液口连接液泵，液泵出液口连接刷圈喷射口上，刷圈喷射口具有两路进水口，一路连接上述的液泵出液口，另一路连接控制阀的陶瓷内壁刷圈进水口，控制阀的自来水进水口连接自来水源，之后分为陶瓷底部喷射口和陶瓷内壁刷圈进水口两路水。本实用新型能够对马桶水路进行消毒，防止水路污染。