本实用新型公开了一种有机肥发酵罐的发酵菌自动接种系统，包括发酵罐和安装在发酵罐底部的支撑腿，所述发酵罐的底部安装有驱动电机，所述驱动电机的输出轴顶部固定连接有贯穿发酵罐顶部的输送螺杆，所述输送螺杆的外表面套设有输送套筒，且所述输送套筒的侧端面通过连接杆与发酵罐固定连接，所述发酵罐的内侧顶部固定连接有呈环形结构的加热管。本实用新型中，首先，随着输送螺杆持续将底部物料向上输送至物料的最上方进行加热灭菌，通过分层加热灭菌的方式，提升了加热灭菌的均匀性，其次，随着输送螺杆持续将底部物料向上输送至物料的最上方进行发酵菌粉的添加，通过分层添加的方式，提升了发酵菌粉添加的均匀性。