本实用新型提供一种金属烟囱穿屋面防水连接结构，包括有楼板、短墙、金属烟囱、隔热层、支架钢板、防水罩、附加防水层、防水层、密封胶层、预设孔、钢套管；所述楼板上预留有矩形状的预设孔，预设孔四周设有450‑500mm高的短墙，短墙与楼板浇筑为一体化钢筋混凝土结构；所述金属烟囱贯穿预设孔，金属烟囱在楼板内部分外表面设有裹紧有隔热层，金属烟囱上对应短墙顶部位置处设有钢套管，钢套管套紧焊接固定在金属烟囱外壁上；所述钢套管四周均匀采用4块支架钢板，支架钢板短边端部两侧设有固定耳，支架钢板长边端焊接固定在钢套管上，支架钢板短边采用螺栓与固定耳相配合固定在短墙顶部并设有密封胶层密封处理，四周的支架钢板上设有防水罩。