本实用新型公开了一种带有鱼厕所的健康养殖系统，在养殖池体内设置有双路排放器，在养殖池体的外侧设置有用于充当鱼厕所的侧位沉淀池，所述的侧位沉淀池沿着养殖池体的侧面设置，所述的侧位沉淀池的一端设置有两个管道口，其中的一个管道进水口与养殖池体中的双路排放器的一个排出口相通，另一个管道出水口与池外排水沟渠相通，所述的双路排放器包含有一大一小两个排水口，小的排水口与侧位沉淀池的一个管道入口相通，大的排水口通过排放管连接至养殖池排水沟渠。本实用新型结构简单，造价低，能有效提升养殖效率，降低饲料系数，极大减少进补水量及养殖尾水排放量，节约水资源，有效保护环境的，且能节能降耗的带有鱼厕所的健康养殖系统。