本实用新型公开了一种外科用医疗器械消毒装置，包括壳体、冲洗机构和消毒机构，所述壳体内壁两侧靠近底部的位置固定连接有同一个电动滑轨，电动滑轨的一侧外壁上滑动连接有滑块，滑块的顶部外壁上通过螺栓固定有第一垫板，所述壳体一侧内壁靠近顶部的位置开有矩形口，矩形口内壁上通过螺栓固定有活性炭过滤板，壳体内壁远离活性炭过滤板的一侧也开有矩形口，矩形口内壁上通过螺栓固定有固定架，固定架外壁靠近活性炭过滤板的一侧固定连接有风扇，且冲洗机构固定连接在壳体的顶部外壁上，消毒机构固定连接在壳体的顶部内壁上。本实用新型可对使用后的医疗器械进行消毒、清洗、干燥、灭菌等操作，操作方便，消毒效率高。