本实用新型提供一种水产车载运输装置，包括运输箱、连接管，所述运输箱内设有至少两个金属箱，所述金属箱下方通过连接管串联；还包括蛋白分离器，所述靠近蛋白分离器的金属箱一侧连接有排水管件，所述排水管件与蛋白分离器的进水管连接；所述出水管连接有出水分管，所述出水分管设置于所述金属箱上方；所述金属箱内设有微生物固化器。本实用新型通过运输箱的特殊设置，可以有效缓解水产动物运输应激，并通过设置的蛋白分离器净化运输水体，结合增压喷头提高水中的溶氧量，在通过微生物固化器优化运输水体环境，提高运输存活率。