本实用新型涉及检疫检验设备领域，公开了一种植物检疫样本提取装置，包括磁力搅拌器和敞口的容器，容器顶部设置有盖体，盖体上插设有进气管和排液管，进气管一端与无菌气源连通，另一端位于靠近盖体内侧的位置；排液管一端位于容器外，另一端穿过盖体并延伸至容器底部；容器安装与磁力搅拌器底座上。本实用新型通过将植物放入容器中，加入无菌水对植物进行浸泡，并用磁力搅拌器进行搅拌使浸泡液充分混合均匀形成病原菌孢子悬浮液，利用进气管充气将病原菌孢子悬浮液由排液管排出至离心试管中；整个检疫样本提取过程操作简单，且完全处于封闭环境，规避了直接采用简单的敞口容器进行浸泡时空气中的细菌等微生物进入容器内影响检疫结果的问题。