本实用新型公开了一种生物制药用试剂瓶清洗装置，包括动力部以及清洗部，动力部包括底座，在底座内设有电连接的蓄电池和电动马达，在底座的侧边设有驱动电动马达开关的控制开关，电动马达的输出连接有转动轴，在转动轴上连接有清洗部，清洗部包括清洗头部，清洗头部上圆周分布有一个以上的梯形卡位槽，在梯形卡位槽内插接有弧形结构的清洗刷，清洗刷上设有与梯形卡位槽配合的梯形卡条，在清洗头部内插接有伸缩式加热棒，的伸缩式加热棒与蓄电池电连接，在伸缩式加热棒的端部连接有与清洗头部配合的密封盖，在底座的底部铰接有连接座，在底座上相对于连接座打开的位置设有充电端口。本结构实现自动旋转清洗，且清洗后可以烘干处理。