本实用新型公开了一种河道治理水体样本检测分层采水器，涉及河道治理技术领域，包括船体，所述船体正面固定连接有限位板，限位板的内部设置有取样筒，取样筒的内部滑动连接有转动柱，转动柱的外表面开设有导水孔。该河道治理水体样本检测分层采水器，通过齿轮盘通过齿条带动取样筒运动，取样筒带动转动柱运动，当取样筒到达需要采水的深度位置处时，停止旋转转动把手，转动转盘，转盘带动转动柱转动，转盘带动滑柱在滑槽的内部转动，当滑柱到达标记块位置处时，停止转动，此时漏水孔和进水孔均与导水孔相连通，水流依次通过进水孔、导水孔，漏水孔进入到采水箱的内部，具备了可对不同深度的水位同时进行水体采样，采样效率高的优点。