本实用新型公开了一种模块化燃料电池动力系统及其应用的应急电源车，模块化燃料电池动力系统包括：若干个可独立或同时工作的燃料电池动力系统模块；氢瓶组，包括支架和若干蓄氢瓶，蓄氢瓶向若干个燃料电池动力系统模块提供氢气使燃料电池动力系统模块发电；逆变器集成柜，包括逆变器和变压器，燃料电池动力系统模块产生的电力通过逆变器集成柜变压后向需电设备供电；电控箱，电控箱控制燃料电池动力系统模块及逆变器集成柜工作；货厢，用于安装燃料电池动力系统模块、氢瓶组、逆变器集成柜和电控箱；若干个燃料电池动力系统模块可以实现个性化搭配功率的同时提供了双重保障，在一套系统坏掉的时候还可以用另外一个顶上继续低功率供电。