本实用新型公开了一种胃肠镜专用清洗设备，包括支撑架和导水管，所述支撑架上端内侧焊接固定有外置框，且外置框内侧焊接固定有伺服电机，所述伺服电机下端活动安装有旋转轴，且旋转轴外侧活动安装有外固定轴承，所述旋转轴下端设置有夹紧组件，且夹紧组件下端设置有辅助清洗组件，所述辅助清洗组件下端设置有单向导流阀。该胃肠镜专用清洗设备，启动伺服电机，伺服电机运行带动旋转轴于外固定轴承内侧转动，旋转轴转动可带动其下端第一连接块和第二连接块之间的胃肠镜转动，胃肠镜在装满清洗剂的清洗桶内转动，可加速胃肠镜的清洗效率，提高清洗质量，且将清洗消毒皂体安置于镂空网兜内，清洗桶内的液体对清洗消毒皂体进行浸泡。