本实用新型提供一种自动灭杀微生物菌种涂布装置，包括底座，所述底座的一侧固定安装有底座支架，所述底座的顶部外侧固定安装有控制箱，所述控制箱的顶部固定安装有按钮，所述底座支架的顶部固定安装有存料箱支架，所述存料箱支架的顶部固定安装有样本箱，所述样本箱远离存料箱支架的一侧固定连接有连接支架，所述连接支架远离样本箱的一侧固定连接有清洗箱，所述清洗箱通过连接支架固定连接有消毒液箱。本实用新型通过底座、底座支架、控制箱、按钮、转动轴承、消毒液进料口、消毒液箱、消毒液管道、样本箱管道壳、涂布滚柱、外部橡胶层和吸附口的配合使用，解决了功能单一，清洗不方便，多是一次性用，浪费成本的问题。