本实用新型公开了一种细胞培养容器的过滤辅助结构，包括过滤箱和设置在过滤箱内部的培养皿，过滤箱顶部的左右两侧均连接有进料管，过滤箱内腔左右两侧之间固定连接有横向隔离板，横向隔离板顶部和底部的中部与过滤箱内腔的顶部和底部之间固定连接有纵向隔离板，本实用新型涉及医学科研中的细胞培养技术领域。该细胞培养容器的过滤辅助结构，利用隔离板将过滤箱分为四个工作室，为过滤箱两个过滤工作同时开展提供条件，便于设置对比例，使得试验结果更加具有说服力，并且在过滤箱内部设置中转机构，用于对添加的营养介质进行存放预热，通过内置的控温机构对过滤箱内的两个过滤室进行温度调控，更大化的利用控温机构。