本实用新型公开了一种便于通风的种子亲本选育隔离装置，包括箱体，所述箱体内部设有渗水箱，所述渗水箱内部设有培育箱，所述培育箱的内部填充有培养土壤，所述培育箱底端和侧壁表面均开设有渗水孔，所述渗水孔内部设有挡网，所述渗水箱一侧外壁表面开设有排水孔。本实用新型通过在箱体的顶端两侧均设置通风孔，便于箱体内部环境的通风，更利于种子的生长，通过在渗水箱一侧设置多个排水孔，通过打开渗水箱一侧不同高度的排水孔，可使渗水箱内保持一定的水位，进而控制培育箱内土壤的吸水量，以达到调控培育箱内土壤湿度的目的，在培育不同种子亲本时，可根据种子的生长特性以控制土壤维持在一定的湿度范围内。