本实用新型公开了一种种子恒温发芽箱，包括箱体和箱门，箱体内设有两个垂直设置的导向杆，且导向杆上设有数个可以沿着导向杆上下移动的托盘，相邻的两个托盘之间通过电动伸缩杆相连接，托盘的底部设有振荡器，箱体内顶部设有风机、温度传感器和湿度传感器，箱体内的一侧设有数个沿箱体的高度方向等距排布的红外加热灯，箱体内的另一侧设有数个沿箱体的高度方向等距排布的喷头。本实用新型结构简单，操作方便，通过风机、红外加热灯和喷头对箱体内的空气含量、温度和湿度进行调节，实现恒温、恒湿控制，同时通过振荡器实现托盘上种子的翻转，发芽均衡，发芽率高，通过电动伸缩杆可以分别调节每层托盘的高度，满足不同身高的操作人员的使用需要。