本实用新型公开了一种两层海水微生物过滤收集设备，包括底板，所述底板上放置有收集烧杯，所述底板上对称固定连接有支撑杆，所述支撑杆远离底板的一端固定连接有框架板，所述框架板上固定连接有过滤网，所述框架板底侧固定固定连接有聚流斗，所述支撑杆上固定连接有支撑板，所述支撑板上放置有过滤筛绢，所述过滤筛绢上固定连接有分流室，所述分流室上固定连接有环形板。本实用新型粗过滤后的海水经过聚流斗进行汇集，然后滴落在分流斗的锥点上进行分散，然后经过锥面平缓的引流后，避免液体泼溅，经过各个斜孔流入引流槽内，使得海水从各个侧面流入过滤筛绢内，使得海水接触过滤筛绢的有效过滤面更广，提高了过滤效率。