本实用新型提供了一种全程循环水养殖系统，包括养殖池，设于养殖池侧壁的净化消毒池，与养殖池相邻设置的水温调节池，以及与净化消毒池相邻设置的热水池，且热水池与水温调节池相邻；净化消毒池内依次设有隔板和过滤板，将池内分别分隔为生物净化池、物理过滤池、消毒池；设置隔板，使生物净化池、物理过滤池之间的水流动无需设置动力机构，节省能源；设置三层过滤网，使得流水内的存留颗粒能被层层过滤，增强了水的净化处理；生化处理、物理过滤、消毒杀菌地层层递进处理，可以保证处理后的水质效果较佳。该系统结构简单且紧凑，占地面积相对较小，其水质处理效果好，能对水温进行有效调控，同时其能量损耗较小的节能型的全程循环水养殖系统。