本实用新型公开了一种防疫用消毒液分瓶灌装装置，包括底座、第一电机、主动齿轮、从动齿轮、旋转轴、支撑座、橡胶保护垫、消毒瓶、第二电机、锥形齿轮一、锥形齿轮二、丝杆、移动座、支撑板、固定柱、灌装头、导液管、进药管、水泵、储液箱、轴承、高度测量光幕、控制箱。本实用新型的有益效果是：通过设置第一电机，第一电机可以带动主从齿轮驱动从动齿轮转动，从而使消毒瓶可以在从动齿轮上旋转进行灌装，提高生产效率，适合不同高度的消毒瓶使用，通过设置控制箱与高度测量光幕，在对不同高度的消毒瓶进行灌装时，高度测量光幕可以检测消毒瓶的高度，从而发送指令控制第二电机运行自动调节灌装头的灌装高度，节约生产成本，提高工作效率。