本实用新型公开了一种细胞离心装置，包括控制器、微型高速电机、离心室，所述控制器与微型高速电机电性连接，所述离心室位于微型高速电机的正上方，所述微型高速电机的上端外表面固定安装有连接件，所述离心室的上端外表面活动安装有盖板，所述盖板的上端外表面中间位置固定安装有第一输送管，所述第一输送管的外圆面靠近下端的位置滑动安装有第二输送管，所述离心室的下端内表面固定安装有底盘。本实用新型，能够通过控制器使得细胞分离实现自动细胞分离与废液的收集，无需人为的进行移动，提高了分离的效率，且全程无需与外界接触，保证了材料的纯净程度，减少检测时出现失误的几率。