本实用新型公开了一种自动控制微波消毒进料装置，包括机架和滑动安装在机架顶部的进料斗以及与进料斗相连的螺旋输送装置，在进料斗的进料口处铰接有盖板，在进料斗内设有拨料装置，拨料电与控制器电连接；在螺旋输送装置的进料口处滑动安装有电动门，在电动门上安装有第一红外感应器，在螺旋输送装置的出料口处安装有第二红外感应器，在螺旋输送装置的出料口底端设有密封挡料装置，第一红外感应器和第二红外感应器以及电动门、密封挡料装置均与控制器电连接，在螺旋输送装置的外壳上设置有水冷套，水冷套与外壳间构成密闭的空心夹层。本实用新型结构简单、操作方便、自动化程度高、减少人员工时、提高生产效率。