本实用新型涉及门禁系统技术领域，尤其涉及全自动移动式隔离防疫消杀门禁系统，其包括密封隔离舱体、负压生成系统、消杀雾剂喷淋系统、电源、温度仪、门禁系统管理解锁系统和控制器；密封隔离舱体的顶端和底端分别设置有进风口和出风口，负压生成系统包括负压机、过滤网和通风管道，密封隔离舱体的底部设置有轮组；还包括用于开启或关闭密封门的动力装置，门禁系统管理解锁系统包括管理者终端、用户终端和门禁系统装置。本实用新型的全自动移动式隔离防疫消杀门禁，可检查进入的人员的体温，可将待检人员封闭至封闭室内，且可以整体转移，可避免出现现待检人员逃离管制的情况，避免其导致更大范围的传染。