本发明涉及生态系统技术领域，尤其为一种新型生态沟渠系统，包括生态沟渠主体、三维植物网、沟壁多孔板、沟底多孔板、拦截箱和生态植物，所述生态沟渠主体的内部下侧设置有拦截箱，所述生态沟渠主体的沟壁与沟底种植有生态植物，通过利用沟壁植物根系与三维植物网的锚固作用达到沟渠结构稳定，待沟壁植物生长稳定后，其表面形成了一层“板‑网‑根‑草”的复合护面层，大大增强了纵向雨水和横向水流的冲蚀能力，拦截箱有助于沟体拦截水流，降缓水速，其中填充的基质对水体中的营养物质具有吸附作用，它和生长其上的植物共同组成一个功能完整的小单元，拦截箱有选择性地在沟中水体污染严重地段或沟渠系统末端摆放以加强沟渠系统的去除功能。