本实用新型涉及海上物流技术领域，具体涉及一种海上物流运输装卸系统，其结构包括装设于船体的装卸臂总成、皮带运输机和斗门机构，装卸臂总成包括装卸臂框架和吊架和装卸臂转动机构，装卸臂框架和吊架的一端与船体铰接，吊架的另一端通过第一绳索与装卸臂框架连接；皮带运输机包括固定于船体的第一托辊架、第一辊筒以和第一皮带；装卸臂框架内部设置有第二托辊架、第二辊筒和第二皮带，第二皮带和第一皮带相连接并形成循环输送回路。上述斗门机构的卸料、装卸臂框架和皮带输送机之间的输送过程中配合衔接连贯，大大提升了船舶转运效率，可实现自动化连续作业，并能根据不同码头的情况调整角度和位置，满足大型远洋散货船的装卸运输需求。