本实用新型公开了一种消化内科内镜清洗装置，包括壳体，所述壳体的内部设置有液箱，所述液箱的内底部设置有微型水泵，所述微型水泵的输出端固定连接有出液管，所述出液管的一端设置有清洗槽，所述清洗槽的两侧均固定连接有限位块，所述限位块的上表面设置有保护箱，所述保护箱的下表面设置有过滤网，所述清洗槽的下表面设置有电机。该消化内科内镜清洗装置，通过保护箱放到清洗槽内，保护箱下方设置过滤网能够使在清洗槽里的清洗液到达保护箱内，并且随着电机的转动将清洗液旋转起来，使清洗液充分接触到内镜，解决了现有的清洗内镜不够彻底的情况，通过液箱能够储存清洗液，并且液箱内设置的微型水泵能够对清洗槽里提液。