本实用新型涉及除臭技术领域，具体涉及一种污水箱自动清风除臭系统，包括底座、控制器、储污箱、进污机构、一级除臭机构和二级除臭机构，所述控制器固定设置于底座顶部，所述储污箱设置于底座顶部一端，所述进污机构固定设置于底座上用以输送污水，所述一级除臭机构设置于底座上并位于控制器旁侧，一级除臭机构包括搭载架和第一除臭组件，所述搭载架通过螺栓固定设置于底座上，所述第一除臭组件设置于搭载架顶部，所述二级除臭机构设置于底座上二级除臭机构包括集气箱、第二除臭组件和外加组件，本实用新型通过打开手动阀并操纵控制器，即可对污水箱自行系统除臭，操作简单，安全高效，极大提高了污水箱自动除臭效率。