本实用新型提供了一种适用于微生物定向进化的培养系统，其能解决目前微生物定向进化中存在的菌种保藏操作繁琐，易染菌的问题。一种适用于微生物定向进化的培养系统，包括培养装置，培养装置包括发酵罐，其特征在于：培养系统还包括菌种保藏装置，菌种保藏装置包括管架、制冷机构、管盖打开机构和管体注液机构，管架开设有2个以上的用于盛放保藏管的管孔；制冷机构用于对盛放于管架上的保藏管进行制冷；管盖打开机构用于打开、闭合保藏管的管盖；管体注液机构用于将将发酵罐中的菌液输送至保藏管中。本实用新型的培养系统，能够实现菌液定期、自动化保藏，避免了人工操作，降低了染菌风险。