本实用新型提供了一种飞机饮用水系统消毒装置及消毒方法，包括带有箱盖的机箱，在机箱内设置臭氧发生系统和用于连通飞机水箱注入接口的连接件，所述的臭氧发生系统包括臭氧发生器、主气泵、次气泵、射流器、静态混合器、二次混合器，主气泵与射流器的进气口连通，次气泵与臭氧发生器的进气口连通，臭氧发生器的出气口与射流器吸气口连通，射流器的出气口通过静态混合器、二次混合器与三通管的一端连通，三通管的另两端第一臭氧浓度检测仪和连接件连通。本方案使用时无需加热，消毒装置不受寒冷气候影响，并且方便移动，提高了工作效率。