本实用新型公开了一种甲醇水重整制氢抽水系统，包括：甲醇水存储罐、制氢模块、氢气缓冲罐、抽水模块、控制模块、供电模块，所述甲醇水存储罐与所述制氢模块管路连接，所述氢气缓冲罐分别与所述制氢模块、抽水模块管路连接，所述制氢模块分别与所述供电模块电性连接，所述甲醇水存储罐、制氢模块、氢气缓冲罐、抽水模块分别与所述控制模块电性连接，所述抽水模块包括内燃机及通过所述内燃机驱动的泵体。本实用新型结构简单，使用方便，由于甲醇水是非常难以点燃的，燃烧生成的几乎都是水且运输起来很方便，使用安全可靠，成本低且环保，有非常好的经济效应，有较高的推广价值。